آخرین مطالب

محققان نرم افزار جدیدی را برای تجزیه و تحلیل داده های تصویربرداری بافت چندگانه توسعه داده اند


محققان نرم افزار جدیدی را برای تجزیه و تحلیل داده های تصویربرداری بافت چندگانه توسعه داده اند

تصویر IMC از سرطان کولورکتال انسان که با SIMPLI به دست آمده است. دایره ای ناحیه ای با چگالی بالا از سلول های سیتوتوکسیک CD8 T و ماکروفاژهای حساس به آنتی ژن است. سرخابی = تومور; قرمز = CD8; فیروزه ای = B2M; سبز = CD68; آبی = CD74. اعتبار: لوسیا مونتورسی

تیمی از محققان از دانشکده‌های سرطان و علوم دارویی و ایمونولوژی و علوم میکروبی کینگز کالج لندن و آزمایشگاه زیست‌شناسی سیستم‌های سرطان در موسسه فرانسیس کریک، به سرپرستی پروفسور فرانچسکا سیکارلی، مقاله جدیدی منتشر کرده‌اند که نرم‌افزار جدیدی را برای تجزیه و تحلیل پیچیده‌ها به نمایش می‌گذارد. داده های تصویربرداری بافتی

فناوری‌های تصویربرداری چندگانه که اخیراً توسعه یافته‌اند، مانند سیتومتری توده تصویربرداری (IMC)، بررسی دقیق ترکیب سلول‌های بافتی را امکان‌پذیر می‌سازد که برای نقشه‌برداری ویژگی‌های سطح بافت بیماری و پیش‌بینی نتیجه درمان‌هایی که به محیط بافت بستگی دارد، مانند ایمونوتراپی سرطان این تکنیک ها معمولاً مقادیر زیادی داده با ابعاد بالا تولید می کنند که تجزیه و تحلیل آنها دشوار است و اغلب به ابزارهای متعدد و کاربرانی با تخصص محاسباتی نیاز دارند.

SIMPLI (شناسایی تک سلولی از تصاویر MultiPlexed) یک نرم افزار منعطف است که تمام مراحل تجزیه و تحلیل داده های تصویربرداری چندگانه را یکپارچه می کند و جایگزین بهبود یافته ای برای تجزیه و تحلیل داده های تصویربرداری با ابعاد بالا برای افراد غیرمتخصص نیز می کند. SIMPLI یک تجزیه و تحلیل فضایی تک سلولی از هر اسلاید بافت و همچنین کمیت های مستقل از سلول بیان نشانگر را برای بررسی ویژگی های غیرقابل تشخیص در سطح سلول انجام می دهد. همچنین خروجی های جدولی و گرافیکی تولید می کند که بازرسی بصری نتایج را در هر مرحله از تجزیه و تحلیل تسهیل می کند.

زمانی که چند سال پیش شروع به کار با داده‌های IMC با ابعاد بالا کردیم، ابزارهای زیادی برای تجزیه و تحلیل آن‌ها وجود نداشت. توسعه ابزار خودمان به لطف استعداد میشل بورتولوماتزی، دکترا، بسیار سرگرم‌کننده بود. پروفسور فرانچسکا سیکارلی گفت.

برای آزمایش عملکرد و تطبیق پذیری SIMPLI، محققان تصاویری را که با فناوری های تصویربرداری مختلف از جمله اما نه محدود به IMC به دست آمده بودند و از نظر مبدا، اندازه و وضوح متفاوت بودند، تجزیه و تحلیل کردند.

کینگز کالج لندن یکی از اولین موسسات در اروپا بوده است که میزبان سیتومتر جرمی تصویربرداری هلیوس است که در پلتفرم فلوسیتومتری BRC موجود است.


فناوری بیوپسی جدید برای تجزیه و تحلیل بیومارکرهای بافت تومور متعدد


اطلاعات بیشتر:
Michele Bortolomeazzi و همکاران، یک رویکرد SIMPLI (شناسایی تک سلولی از تصاویر MultiPLexed) برای فنوتیپ بافتی با تفکیک فضایی در وضوح تک سلولی، ارتباطات طبیعت (2022). DOI: 10.1038/s41467-022-28470-x

ارائه شده توسط کینگز کالج لندن

نقل قول: محققان نرم افزار جدیدی را برای تجزیه و تحلیل داده های تصویربرداری بافت چندگانه توسعه می دهند (2022، 9 فوریه) که در 9 فوریه 2022 از https://medicalxpress.com/news/2022-02-software-analysis-multiplexed-tissue-imaging.html بازیابی شده است.

این برگه یا سند یا نوشته تحت پوشش قانون کپی رایت است. به غیر از هرگونه معامله منصفانه به منظور مطالعه یا تحقیق خصوصی، هیچ بخشی بدون اجازه کتبی قابل تکثیر نیست. محتوای مذکور فقط به هدف اطلاع رسانی ایجاد شده است.