آخرین مطالب

استفاده از پروفایل تک سلولی با وضوح بالا برای درک پاسخ ایمنی در COVID-19 شدید


استفاده از پروفایل تک سلولی با وضوح بالا برای درک پاسخ ایمنی در COVID-19 شدید

شکل 1: طرح کلی مطالعه و نتایج خوشه بندی سلولی. هجده نمونه PBMC از ده بیمار COVID-19 و همچنین 13 نمونه کنترل در این مطالعه وارد شدند. تمام بیماران COVID-19 نمونه‌های PBMC را در دو مقطع زمانی مورد تجزیه و تحلیل قرار دادند، به جز دو بیمار پیشرونده که تنها پس از درمان با توسیلیزوماب نمونه‌برداری شدند. فلوچارتی از روشهای تهیه نمونه و انواع کتابخانه تک سلولی مورد استفاده در این مطالعه. هر نمونه PBMC COVID-19 پس از ذوب به دو قسمت تقسیم شد و به صورت موازی با دو روش: معمولی و CITE-seq پردازش شد. نمونه‌های PBMC کنترل فقط با روش آماده‌سازی نمونه مرسوم، بدون CITE-seq پردازش شدند. b نمایش ماتریس همه 18 نمونه COVID-19 استفاده شده، بر اساس پیشرفت بیماری، درمان توسیلیزوماب، و زمان خونگیری. c راهنمای کدها و رنگ های بیمار مورد استفاده در این نسخه خطی. d طرحی که زمان علائم، بستری شدن در بیمارستان، خونگیری و درمان با توسیلیزوماب را برای هر یک از 10 بیمار COVID-19 نشان می دهد. e جاسازی UMAP از رونوشت های تک سلولی از 153554 سلول از 18 نمونه COVID-19 و 13 نمونه PBMC کنترل، با انواع سلول ها حاشیه نویسی شده است. جعبه چین دار دو دسته از مونوسیت های کلاسیک، HLADRhi (#7) و S100Ahi/HLADRlo (#1) را نشان می دهد. f مقایسه تعداد سلول های افتراقی (به عنوان درصد از تمام PBMC ها) بین گروه های بیمار برای هر یک از انواع سلول های مشروح نشان داده شده در e. نتایج در نمودارهای جعبه ای نشان داده می شوند که در آن مقدار هر نمونه با یک نقطه نشان داده می شود، کران های بالا و پایین به ترتیب صدک های 75 و 25 درصد را نشان می دهند. میله‌های مرکزی میانگین‌ها را نشان می‌دهند و سبیل‌ها مقادیر تا 1.5 محدوده بین چارکی را بالای 75 درصد یا زیر صدک‌های 25 درصد نشان می‌دهند. تعداد بیماران (n) برای هر گروه در شکل نشان داده شده است. *p-value

یک مطالعه جدید توسط محققان دانشگاه Yale به دانش ما در مورد نحوه مبارزه سیستم ایمنی بدن با ویروسی که باعث COVID-19 می شود، اضافه می کند.

پاسخ‌های ایمنی اغراق‌آمیز که عفونت شدید COVID-19 را مشخص می‌کند به خوبی درک نشده است. در پاسخ به آسیب یا عفونت، سیستم ایمنی یک واکنش هماهنگ بین اجزای مختلف خود نشان می‌دهد که بدون آسیب رساندن به فرد آلوده، عفونت را از بین می‌برد. محققان دانشگاه ییل کشف کردند که در بیماران مبتلا به کووید-19 شدید، این هماهنگی از بین می رود و منجر به تقویت کنترل نشده سیستم ایمنی بدن می شود.

این تحقیق در 21 ژانویه منتشر شد ارتباطات طبیعت.

آنها اکتشافات خود را با استفاده از سلول های خونی به دست آمده از بیماران در طول پیشرفت بیماری، در مراحل اولیه و اواخر بیماری در بیماران بستری شده اما بهبود یافته و در بیماران مبتلا به کووید-19 پیشرونده که نیاز به بستری شدن در بیمارستان داشتند و در نهایت تسلیم بیماری شدند، انجام دادند.

محققان از فناوری‌های جدیدی به نام چند omics تک سلولی استفاده کردند که وضوح آنالیز مولکولی را به‌طور چشمگیری افزایش می‌دهد و اجازه می‌دهد تا همه ژن‌ها و بسیاری از پروتئین‌ها را در هر سلول مشخص کنیم. نویسنده اول مقاله، آوراهام اونترمن، دکترای MBA، که قبلا از آزمایشگاه کمینسکی ییل بود، توضیح داد: «این امکان تعریف دقیق سلول‌های ایمنی، مسیرها و مکانیسم‌هایی که در آنها فعال می‌شوند و سیگنال‌هایی که به سلول‌های دیگر ارسال می‌کنند را می‌دهد. که در حال حاضر رئیس خدمات فیبروز ریوی در موسسه ریوی در مرکز پزشکی تل آویو است. نفتالی کامینسکی، MD، Boehringer Ingelheim Pharmaceuticals, Inc. و استاد پزشکی در دانشکده پزشکی ییل و نویسنده ارشد این مطالعه است. این تکنیک، فناوری‌های چند سلولی چند سلولی نامیده می‌شود.

چارلز دلا کروز، MD، Ph.D.، همچنین یکی از نویسندگان ارشد مقاله افزود: سیستم ایمنی تطبیقی، که به پاتوژن ها حمله می کند، و سیستم ایمنی ذاتی، که در ابتدا عفونت را تشخیص می دهد، قرار است هماهنگ باشند. زمانی که آنها هماهنگ نباشند، پاکسازی ویروس به تعویق می‌افتد، عفونت تقویت می‌شود و پاسخ ایمنی میزبان به ویروس بی‌نظم می‌شود که می‌تواند برای بیماران بسیار خطرناک باشد.»

نویسنده اول مقاله، Tomokazu S. Sumida، MD، Ph.D.، استادیار (عصب شناسی)، افزود: “این یک تلاش شگفت انگیز بود. ما نمونه ها را جمع آوری کردیم و جدیدترین فناوری ها را برای نمایه سازی سیستم ایمنی به کار بردیم. با نتایجی که بینش واقعی در مورد روند بیماری ناشی از ویروس ارائه می دهد.” دیوید ا. هافلر، MD، ویلیام اس. و لویس استایلز ادگرلی، استاد نورولوژی و پروفسور ایمونوبیولوژی، نویسنده ارشد این مطالعه است.

دلا کروز گفت: «برای توسعه درمان‌های شدید COVID-19، باید پاسخ ایمنی را درک کنیم. “در حالی که در حال حاضر مداخلات ضد التهابی وجود دارد، آنها خاص نیستند. یافته های این مطالعه ممکن است امکان شناسایی درمان های جدید را فراهم کند. این کار واقعاً گواهی از تلاش های مشترک بسیاری از افرادی بود که به همه گیری پاسخ دادند.” نمونه‌های بالینی از طریق تلاش‌های تیم Yale IMPACT که بیماران مبتلا به COVID-19 را استخدام کردند، به‌دست آمد.

یکی از همکاران Xiting Yan، Ph.D. گفت که داشتن یک تیم تحقیقاتی بین رشته ای کلید موفقیت این مطالعه بود. یان گفت: «تلفیقی که هنگام کار ایمونولوژیست‌ها، پزشکان و زیست‌شناسان با زیست‌شناسان محاسباتی و بیوانفورماتیکان ایجاد می‌شود، بسیار قدرتمند است و برای این مطالعه ضروری است».


چرا برخی از موارد کووید شدیدتر از بقیه هستند؟ موش‌های «انسان‌شده» سرنخی ارائه می‌دهند


اطلاعات بیشتر:
Avraham Unterman و همکاران، چند omics تک سلولی ناهمزمانی سیستم ایمنی ذاتی و سازگار را در COVID-19 پیشرونده نشان می دهد. ارتباطات طبیعت (2022). DOI: 10.1038/s41467-021-27716-4

ارائه شده توسط دانشگاه ییل

نقل قول: استفاده از پروفایل تک سلولی با وضوح بالا برای درک پاسخ ایمنی در COVID-19 شدید (2022، 10 فوریه) بازیابی شده در 10 فوریه 2022 از https://medicalxpress.com/news/2022-02-high-resolution-single- cell-profiling-immune-response.html

این برگه یا سند یا نوشته تحت پوشش قانون کپی رایت است. به غیر از هرگونه معامله منصفانه به منظور مطالعه یا تحقیق خصوصی، هیچ بخشی بدون اجازه کتبی قابل تکثیر نیست. محتوای مذکور فقط به هدف اطلاع رسانی ایجاد شده است.