آخرین مطالب

محققان انواع کووید-19 را با پتانسیل فرار از پاسخ ایمنی سلولی شناسایی کردند –


تعدادی از سویه‌های موجود SARS-CoV-2، و همچنین انواع دیگری که ممکن است در آینده ایجاد شوند، پتانسیل فرار از پاسخ سلول‌های T سیتوتوکسیک سیستم ایمنی را در بخشی از جمعیت دارند. این نتیجه یک مطالعه مدل سازی جدید است که در 10 فوریه منتشر شد زیست شناسی محاسباتی PLOS توسط آنتونیو مارتین-گالیانو از موسسه بهداشت کارلوس سوم، اسپانیا و همکارانش.

پاسخ سلول های T در انسان به طور ژنتیکی توسط مولکول های HLA کدگذاری می شود – این بدان معناست که افراد مختلف HLA های متفاوتی دارند که برای شناسایی پاتوژن های مهاجم بر اساس قسمت های مختلف یا “اپی توپ” های پاتوژن برنامه ریزی شده اند. با وجود هزاران مولکول HLA مختلف در جمعیت انسانی و هزاران اپی توپ احتمالی در هر ویروس معین، ارزیابی تجربی پاسخ ایمنی هر آلل HLA انسانی به هر گونه ویروسی امکان پذیر نیست. با این حال، روش های محاسباتی می تواند این کار را تسهیل کند.

در مطالعه جدید، محققان ابتدا مجموعه کامل اپی توپ ها را از سویه مرجع اصلی SARS-CoV-2 از ووهان، چین تعیین کردند. این تیم 1222 اپی توپ از SARS-CoV-2 را کشف کرد که با زیرگروه های اصلی HLA مرتبط بود که حدود 90 درصد از جمعیت انسان را پوشش می داد. حداقل 9 نفر از هر 10 نفر می توانند بر اساس این 1222 اپی توپ، پاسخ سلول T را به COVID-19 نشان دهند.

سپس، محققان به صورت محاسباتی تجزیه و تحلیل کردند که آیا هر یک از 118000 ایزوله مختلف SARS-CoV-2 از سراسر جهان که در مجموعه داده های مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) توضیح داده شده است، جهش در این اپی توپ ها داشته است یا خیر. آنها نشان دادند که 47 درصد از اپی توپ ها در حداقل یک ایزوله موجود جهش یافته بودند. در برخی موارد، جدایه های موجود دارای جهش در مناطق اپی توپ متعدد بودند، اما جهش های تجمعی هرگز بیش از 15 درصد اپی توپ ها را برای هر نوع آلل HLA خاصی تحت تأثیر قرار ندادند. هنگامی که تیم آلل های حساس و منشاء جغرافیایی جدایه های فرار مربوط به آنها را تجزیه و تحلیل کردند، تیم دریافتند که آنها در برخی مناطق جغرافیایی – از جمله جنوب صحرای آفریقا و آسیای شرقی و جنوب شرقی – وجود دارند که نشان دهنده فشار ژنتیکی بالقوه بر روی سیتوتوکسیک است. پاسخ سلول های T در این مناطق.

نویسندگان می‌گویند: «انباشتگی این تغییرات در جدایه‌های مستقل هنوز آنقدر کم است که جمعیت انسانی جهان را تهدید کند. پروتکل ما جهش‌هایی را شناسایی کرده است که ممکن است برای جمعیت‌های خاص مرتبط باشد و نظارت عمیق‌تری را ایجاب کند.»

با این حال، مارتین-گالیانو خاطرنشان می کند که “جهش های نادیده گرفته SARS-CoV-2” ممکن است در آینده “پاسخ T سیتوتوکسیک را در زیرجمعیت های انسانی تهدید کند.”

منبع داستان:

مواد ارائه شده توسط PLOS. توجه: محتوا ممکن است برای سبک و طول ویرایش شود.