آخرین مطالب

ردیابی انتقال انواع متمایز SARS-COV-2 از چین و اروپا به غرب آفریقا


ردیابی انتقال انواع متمایز SARS-COV-2 از چین و اروپا به غرب آفریقا

نقشه جغرافیایی الگوهای متمایز معرفی انواع ویروس مبتنی بر چین و اروپا به کشورهای غرب آفریقا (تا آوریل 2020) را نشان می دهد. اعتبار: Wruck, W, Adjaye J, Heinrich-Heine-University Dusseldorf, آلمان

با شروع همه‌گیری SARS-CoV-2، ترس‌هایی به وجود آمد که سیستم‌های بهداشتی ضعیف در بسیاری از کشورهای آفریقایی را تحت تأثیر قرار دهد. با این حال، مشخص شد که اروپا و آمریکا در مقایسه با آفریقا میزان بروز و مرگ و میر بسیار بالاتری داشتند. دلایل این امر ممکن است در جمعیت نسبتاً جوان، عفونت های ویروسی قبلی و آب و هوای گرم باشد. با این وجود، SARS-CoV-2 همه کشورهای آفریقایی را تحت تأثیر قرار داد و بنابراین ابتکاراتی برای توزیع جهانی واکسن‌ها آغاز شد. ژنوم ایزوله های ویروسی به طور مداوم در اکثر کشورها توالی یابی می شوند. توالی‌های DNA را می‌توان تحت آنالیز فیلوژنتیک قرار داد تا منشأ انواع ویروسی شناسایی شود و توسعه و توزیع انواع جدیدی که ممکن است خفیف‌تر یا در بدترین حالت کشنده‌تر باشند، نظارت شود. محققان دانشگاه هاینریش هاینه دوسلدورف اکنون الگوهای متمایز گونه‌های SARS-CoV-2 را در تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی توالی‌های ویروسی از کشورهای غرب آفریقا – گامبیا، غنا، نیجریه و سنگال، پرده‌برداری کرده‌اند. پروفسور دکتر جیمز آجایه نویسنده ارشد این مطالعه است که در گزارش های علمی. بیوانفورماتیک Wasco Wruck اولین نویسنده مقاله است.

اگرچه چهار کشور مورد بررسی شرایط جغرافیایی و آب و هوایی مشابهی دارند، اما محققان الگوهای متفاوتی از انواع ویروس را پیدا کردند. این ممکن است منعکس کننده یک مکانیسم رانش ژنتیکی به نام “اثر بنیانگذار” باشد که در آن تنوع ژنتیکی تنها توسط بخش کوچکی از جمعیت ایجاد می شود که یک جمعیت جداگانه جدید را تشکیل می دهد، به عنوان مثال افراد آلوده خاص که انواع ویروس را از فرانسه به سنگال منتقل می کنند. “وقتی به الگوهای متمایز انواع ویروس نگاه می کنید، می توانید مستقیماً روابط تاریخی را مشاهده کنید، به عنوان مثال سنگال مستعمره فرانسه بود و الگوی مشابه فرانسه دارد زیرا هنوز ترافیک و تجارت زیادی بین سنگال و فرانسه وجود دارد. غنا و نیجریه هر دو هستند. جیمز آجایه، پروفسور غنائی-بریتانیایی در دانشکده پزشکی دانشگاه هاینریش هاینه دوسلدورف و مدیر موسسه ساقه می گوید: مستعمرات سابق بریتانیا با الگوهای ویروسی مشابه. هر دو کشور با اروپا و چین روابط تجاری و کاری دارند. تحقیقات سلولی و پزشکی بازساختی. Wruck اضافه می کند که “به طور شگفت انگیزی، ما دریافتیم که انواع بعدی از اروپا قبل از انواع قبلی شناسایی شدند. توضیحات برای این می تواند این باشد که انواع ویروس های قبلی به طور پنهان در گردش بودند و انواع بعدی زودتر شناسایی شدند زیرا قابلیت انتقال ویروس بالاتر بود.”

از آنجایی که SARS-CoV-2 یک ویروس RNA است، زمانی که RNA در داخل سلول‌های میزبان انسان کپی می‌شود، جهش‌ها ممکن است ایجاد شوند. در تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک، الگوهای مشابهی از جهش‌ها که به منشأهای مشابه اشاره می‌کنند، در شاخه‌های یک درخت در کنار هم قرار می‌گیرند که اگر به اندازه کافی بزرگ باشند، می‌توان آن‌ها را انواع نامید. جهش ها نمی توانند تأثیری داشته باشند یا می توانند منجر به جایگزینی اسیدهای آمینه شوند که ممکن است عملکرد یا ساختار پروتئین های ویروسی را تغییر دهد. پروفسور Adjaye و همکارش توالی SARS-CoV-2 را از چهار کشور غرب آفریقا از پایگاه داده GISAID دانلود کردند و از توالی هایی از چین، اروپا و آمریکا به عنوان مرجع استفاده کردند. با استفاده از تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک، این توالی‌ها می‌توانند با انواع ویروسی مرتبط باشند، همچنین الگوهای متمایز انواع مختلف برای هر کشور قابل شناسایی است. در مرحله اول مطالعه در آوریل 2020، برجسته ترین جایگزینی اسید آمینه تغییر اسید آسپارتیک (D) توسط گلایسین (G) در موقعیت 614 (D614G) در پروتئین اسپایک ویروس (ناشی از RNA) بود. جهش A23403G). Wruck می گوید که “ما دیدیم که D614G به تدریج در آوریل 2020 جایگزین انواع دیگر شد. در ژوئن 2021، آنها را جایگزین کرد و در همه انواع جدید مانند آلفا (α) و دلتا (δ) گنجانده شد. در اکتبر 2021، نوع دلتا تحت سلطه قرار گرفت و در آینده این سوال مطرح خواهد شد که کدام زیرشاخه دلتا غالب خواهد شد؟” نوع دلتا با یک مزیت تکاملی گسترش می یابد زیرا جایگزینی اسید آمینه منجر به انتقال بالاتر در جمعیت می شود.

Wruck می‌گوید: «در آوریل 2020 ما فقط توانستیم چند جهش نادر را که به نظر می‌رسید از غرب آفریقا سرچشمه می‌گیرد، شناسایی کنیم، در ژوئن 2021 نوع Eta (η) وجود داشت که از نیجریه سرچشمه می‌گرفت. Adjaye می افزاید که “نظارت مداوم توالی های ویروسی برای فعال کردن کنترل انتقال انواع جدید و ارزیابی اثربخشی واکسن مورد نیاز است. با این حال، برای درمان های آینده نیز درک بهتر مکانیسم های زمینه ای COVID19 ضروری است همانطور که در انتشار قبلی توضیح دادیم. تغییرات مولکولی ناشی از عفونت SARS-CoV-2 در سلول‌های ریه. کلیه دومین عضو آسیب‌دیده است و گزارش‌هایی از بزرگسالان آلوده به COVID-19 گزارش شده است که دچار آسیب حاد کلیه (AKI) و از دست دادن ناگهانی کلیه شده‌اند. ما در حال حاضر پروتئین اسپایک تولید شده در آزمایشگاه (که اساس واکسن‌های فعلی است) را به سلول‌های کلیه انسان جدا شده از نمونه‌های ادرار معرفی می‌کنیم. این کار باید ژن‌ها و مسیرهای قابل داروسازی مرتبط با طوفان سیتوکین، آسیب سلولی و آسیب کلیه را روشن کند. ”


آنتی بادی های COVID-19 10 ماه پس از عفونت در بدن باقی می مانند


اطلاعات بیشتر:
Wasco Wruck و همکاران، تجزیه و تحلیل دقیق فیلوژنتیک، انتقال گونه های متمایز SARS-COV-2 را از چین و اروپا به غرب آفریقا دنبال می کند. گزارش های علمی (2021). DOI: 10.1038/s41598-021-00267-w

ارائه شده توسط دانشگاه هاینریش هاینه دوسلدورف

نقل قول: ردیابی انتقال انواع متمایز SARS-COV-2 از چین و اروپا به غرب آفریقا (2021، 16 نوامبر) در 16 نوامبر 2021 از https://medicalxpress.com/news/2021-11-tracking-transmission-distinct-sarscov2 بازیابی شده است. -variants.html

این برگه یا سند یا نوشته تحت پوشش قانون کپی رایت است. به غیر از هرگونه معامله منصفانه به منظور مطالعه یا تحقیق خصوصی، هیچ بخشی بدون اجازه کتبی قابل تکثیر نیست. محتوای مذکور فقط به هدف اطلاع رسانی ایجاد شده است.