توزیع زمانی توالیهای SARS-CoV-2 VOCs، درصد توزیع زمانی توالیهای دودمان نوترکیب SARS-CoV-2 و تعداد روزانه دودمان در گردش: (الف) شیوع انواع نگرانیها (VOC) SARS-CoV-2 با X- محور که تاریخ جمع آوری توالی را نشان می دهد، محور Y که چندین توالی جمع آوری و ذخیره شده را در میانگین 7 روزه نشان می دهد. VOC های مختلف در رنگ های منحصر به فرد نشان داده می شوند. (B) درصد توالیهای متعلق به هر دودمان نوترکیب با محور X و محور Y مانند شکل تکمیلی 1A. دودمان های نوترکیب مختلف با رنگ های منحصر به فرد نشان داده شده اند که همان رنگی است که برای نشان دادن دودمان نوترکیب در شکل 1A استفاده می شود. (C) منحنی مساحتی که تعداد دودمانهای منحصربهفرد رایج روزانه را نشان میدهد، با محور X نشاندهنده تاریخ جمعآوری دنباله دودمان، محور Y نشاندهنده تعداد دودمان منحصربهفرد در گردش در هر روز و رنگها نشاندهنده نوع دودمان (نوترکیب) —قرمز، همه دودمان—خاکستری تیره. محور X هر سه نمودار از 1 دسامبر 2019 تا 1 ژوئیه 2022 با تیکهای محوری که ماهها را نشان میدهند و همتراز هستند و آنها را از نظر زمانی با یکدیگر مقایسه میکند. اعتبار: مجله ویروس شناسی پزشکی (2023). DOI: 10.1002/jmv.28519
در ژانویه 2022، تقریباً در زمانی که نوع میکرون SARS-CoV-2 به سرعت شروع به گسترش کرد، تیمی از محققان در موسسه علوم هند (IISc) به رهبری شاشانک تریپاتی، استادیار دپارتمان میکروبیولوژی و زیست شناسی سلولی، و مرکز تحقیقات بیماریهای عفونی، متوجه شدند که افزایش غیرعادی بالایی در تعداد سویههای نوترکیب نوع omicron وجود دارد.
این تیم توالیهای ژنومی همه سویههای ویروسی را که بین نوامبر ۲۰۱۹ و جولای ۲۰۲۲ در پایگاههای اطلاعاتی مختلف در سرتاسر جهان ظاهر شدند، تجزیه و تحلیل کردند. در یک مطالعه منتشر شده در مجله ویروس شناسی پزشکیآنها چندین جهش جدید را شناسایی کردهاند که از طریق نوترکیبی با سرعت بالایی انباشته شده و پروتئینهای ویروسی، به ویژه بخشهای مختلف (دامنه) پروتئین اسپایک ویروسی را تحت تأثیر قرار دادهاند.
این دامنهها – مانند دامنه اتصال گیرنده (RBD) و دامنه N ترمینال (NTD) – در اتصال ویروس به میزبان شناخته شدهاند و همچنین به عنوان مکانهای حمله توسط سیستم ایمنی میزبان گزارش شدهاند. این تیم نشان داد که با کمک این جهشها، چندین سویه نوترکیب و جهش یافته omicron توانستند از دفاع میزبان فرار کرده و محکمتر به سلول میزبان متصل شوند.
مشاهدات آنها به شواهد فزایندهای درباره میزان کارآمدی سویههای جدید ویروس در فرار از حمله ایمنی و ایجاد عفونت میافزاید.
ویروس هایی مانند SARS-CoV-2 به طور مداوم تغییر می کنند و شناسایی و نابودی آنها را برای سیستم ایمنی بدن دشوار می کند. این یک نگرانی عمده در هنگام تولید واکسن است. ماده ژنتیکی در SARS-CoV-2 یک RNA تک رشته ای بلند است. علاوه بر این، پروتئینی که برای ساختن کپی از این RNA لازم است – RNA پلیمراز – در این ویروس مستعد خطا است.
Tripathi توضیح می دهد که ویروس ها می توانند از طریق یکی از دو مکانیسم تکامل یابند: جهش یا نوترکیب. این یک استراتژی برای افزایش تنوع ژنتیکی آن است. پلیمراز نه تنها به جهشها اجازه انباشته شدن میدهد، بلکه اغلب باعث ایجاد نوترکیبی بین سویههای مختلف ویروس میشود. این امکان زمانی وجود دارد که عفونت همزمان وجود داشته باشد – زمانی که یک سلول میزبان توسط بیش از یک سویه ویروس آلوده شده باشد.
Tripathi میگوید: «هنگام کپی کردن RNA ویروسی، پلیمراز میتواند از یک الگوی RNA به الگوی دیگری که نزدیک است بپرد. اگر دنباله نزدیک سویه دیگری باشد، کپی جدید یک نوترکیب یا ترکیبی از دو سویه والدین خواهد بود. تریپاتی می گوید که در حال حاضر بیش از 35 نوترکیب SARS-CoV-2 وجود دارد. به عنوان مثال، یکی از انواع کارآمدتر، XBB، که در سال 2022 ظاهر شد، از ترکیب دو نسخه دیگر از omicron متولد شد.
بر اساس این مطالعه، دو دلیل احتمالی برای افزایش این رویدادهای نوترکیبی وجود دارد. اولاً، تعداد عفونتها و عفونتهای همزمان در طول موج اومیکرون 2022 زیاد بود. دوم، تیم متوجه شد که یک جهش خاص در یک ژن ویروسی برای یک اگزونوکلئاز ظاهر شده است، پروتئینی که می تواند RNA را بشکند و اعتقاد بر این است که در نوترکیبی نقش دارد. تریپاتی توضیح میدهد: «یافتههای ما نشان میدهد که ویروس در حال سرد شدن نیست، اما در واقع تا آنجایی که جهشها پیش میروند گرم میشود.»
به گفته محققان، از آنجایی که نوترکیبی تقویتشده میتواند شانس ظهور سویههای جدید را افزایش دهد، ردیابی چنین نوترکیبیهایی از طریق توالییابی منظم ویروس بسیار مهم است.
اطلاعات بیشتر:
ریشاد شیراز و همکاران، نوترکیبی پیشرفته در میان زیر متغیرهای Omicron SARS-CoV-2 به فرار سیستم ایمنی ویروسی کمک می کند. مجله ویروس شناسی پزشکی (2023). DOI: 10.1002/jmv.28519
ارائه شده توسط موسسه علوم هند
نقل قول: مطالعه (2023، 20 مارس) که در 20 مارس 2023 از https://medicalxpress.com/news/2023-03-recombination-omicron-variants-shown-contributes بازیابی شده است، نشان می دهد که نوترکیبی پیشرفته در میان گونه های omicron نشان داده شده به فرار ایمنی ویروسی کمک می کند. html
این برگه یا سند یا نوشته تحت پوشش قانون کپی رایت است. به غیر از هرگونه معامله منصفانه به منظور مطالعه یا تحقیق خصوصی، هیچ بخشی بدون اجازه کتبی قابل تکثیر نیست. محتوای مذکور فقط به هدف اطلاع رسانی ایجاد شده است.