زیست‌شناسان پورتال داده Cancer-Immu را برای پیش‌بینی پاسخ به ایمونوتراپی مسدودکننده ایست بازرسی ایمنی راه‌اندازی کردند –

این تیم جزئیاتی را در مورد پورتال دسترسی آزاد در مقاله ای که در 13 دسامبر منتشر شد ارائه کرد تحقیق سرطان. Cancer-Immu داده های omics چند بعدی در مقیاس بزرگ، از جمله پروفیل های ژنومی ژنتیکی، حجیم و تک سلولی، پروتئومی و پویا را ادغام می کند. همچنین فنوتیپ های بالینی را ادغام می کند.

در حالی که مهارکننده‌های ایمن‌پوینت می‌توانند برای برخی از بیماران مبتلا به سرطان نجات‌دهنده باشند، اکثر بیماران به ایمنی‌درمانی‌ها پاسخ نمی‌دهند. محققان در حال کار برای شناسایی نشانگرهای زیستی هستند که پاسخ را پیش‌بینی می‌کنند و Cancer-Immu یک پورتال عملکردی جامع برای کشف ارتباطات ایمنی-ژنومی ارائه می‌دهد.

دکتر یو شایر، رئیس بخش آمار زیستی در VUMC، رئیس هارولد ال. موزس، رئیس بخش تحقیقات سرطان و یکی از پژوهشگران، می‌گوید: «این دسترسی آسان به داده‌های ایمنی‌زا را فراهم می‌کند و محققان را قادر می‌سازد تا مجموعه داده‌های omics را به بینش‌های بیولوژیکی و کاربردهای بالینی ترجمه کنند. نویسندگان ارشد مقاله به گفته Qi Liu، دکترا، دانشیار آمار زیستی و نویسنده ارشد دیگر مقاله، “Cancer-Immu بیشترین تعداد مجموعه داده ها و انواع داده های omics را در مقایسه با پایگاه های داده موجود با پیامد پاسخ به محاصره ایست بازرسی ایمنی پوشش می دهد.”

انواع سرطان در پورتال داده شامل ملانوم، سرطان ریه سلول غیر کوچک، سرطان اروتلیال متاستاتیک، کارسینوم سلول کلیوی، سرطان مثانه، گلیوما، سرطان کولورکتال، سرطان سر و گردن، سرطان مری معده، سرطان با علت اولیه ناشناخته، سرطان معده، سرطان سینه، سرطان کبد، سرطان پروستات، کارسینوم سلول بازال و سرطان پوست غیر ملانوم.

با پورتال Cancer-Immu، پزشکان و محققان می توانند داده های خود را آپلود و تجزیه و تحلیل کنند یا با داده های موجود به طور همزمان تجزیه و تحلیل کنند. آنها می توانند از متاآنالیز یا آنالیز پان سرطان استفاده کنند. این پورتال مجموعه‌ای از سه نوع داده omics دارد: داده‌های ژنتیکی، رونویسی و داده‌های تک سلولی. ماژول پان سرطان که چندین مجموعه داده را در یک مجموعه جمع می کند، تشخیص و تجزیه و تحلیل ویژگی های نادر را افزایش می دهد. متخصصان آمار زیستی در این مطالعه خاطرنشان کردند که در حالی که متاآنالیز – ارزیابی آماری مطالعات مستقل بر روی همان سوال متمرکز بود – نتوانست جهش‌های ژنی قابل توجهی را تشخیص دهد، تجزیه و تحلیل پان سرطان، که ارزیابی گسترده‌تری در بین انواع مختلف سرطان است. 182 ژن با جهش به طور قابل توجهی با مهار کننده های ایست بازرسی ایمنی مرتبط است.

اولین نویسنده این مطالعه، دکتر جینگ یانگ، محقق فوق دکترا در آزمایشگاه تحقیقاتی Shyr، گفت: «Cancer-Immu به رفع کمبود و چالش برای ارزیابی اثربخشی نشانگرهای زیستی شناخته شده و کشف امضاهای جدید کمک می کند.

تحقیقاتی که منجر به تأسیس Cancer-Immu شد، توسط مؤسسه ملی سرطان با کمک مالی SPORE در سرطان گوارش، SPORE در سرطان پستان، و کمک مالی از مرکز سرطان حمایت شد.

منبع داستان:

مواد ارائه شده توسط مرکز پزشکی دانشگاه وندربیلت. نوشته اصلی توسط تام وایلمون. توجه: محتوا ممکن است برای سبک و طول ویرایش شود.