آخرین مطالب

اکثر انواع ژنتیکی “بیماری زا” خطر کم ایجاد بیماری دارند –


تصور کنید در یک آزمایش ژنتیکی نتیجه مثبت بگیرید. پزشک به شما می گوید که شما یک “نوع ژنتیکی بیماری زا” یا یک توالی DNA دارید که احتمال ابتلا به بیماری هایی مانند سرطان سینه یا دیابت را افزایش می دهد. اما این شانس ها دقیقاً چه هستند — 10 درصد؟ پنجاه درصد؟ یکصد؟ در حال حاضر، پاسخ به این سوال آسان نیست.

برای رفع این نیاز، محققان دانشکده پزشکی ایکان در کوه سینا، توالی‌های DNA و داده‌های پرونده سلامت الکترونیکی هزاران نفر را که در دو بانک زیستی عظیم ذخیره شده بودند، تجزیه و تحلیل کردند. به طور کلی، آنها کشف کردند که احتمال اینکه یک نوع ژنتیکی بیماریزا واقعاً باعث ایجاد بیماری شود، نسبتاً کم است – حدود 7 درصد. با این وجود، آنها همچنین دریافتند که برخی از انواع، مانند انواع مرتبط با سرطان سینه، با طیف وسیعی از خطرات بیماری مرتبط هستند. نتایج، منتشر شده در جاما، می تواند نحوه گزارش خطرات مرتبط با این انواع را تغییر دهد و روزی به راهنمایی پزشکان در تفسیر نتایج آزمایشات ژنتیکی کمک کند.

دکتر ران دو، دانشیار ژنتیک و علوم ژنومی، گفت: «هدف اصلی این مطالعه تولید آمارهای مفید و پیشرفته ای بود که به طور کمی تأثیر انواع ژنتیکی عامل بیماری شناخته شده بر خطر ابتلا به بیماری را ارزیابی می کند. یکی از اعضای موسسه چارلز برونفمن برای پزشکی شخصی در کوه Icahn Sinai.

در طول 20 سال گذشته دانشمندان صدها هزار نوع را کشف کرده اند که می توانند باعث بیماری های مختلف شوند. با این حال، به دلیل ماهیت این اکتشافات، تخمین – یا ارائه آماری در مورد – خطر واقعی وقوع این اتفاق برای هر گونه ژن دشوار بوده است. تاکنون، بیشتر تخمین‌ها بر اساس مطالعاتی بوده است که شامل تعداد کمی از افراد بود که یا بخشی از خانواده‌ای بودند که سابقه ابتلا به بیماری را داشتند یا در کلینیک‌های خاص بیماری استخدام شده بودند. اما مطالعاتی مانند اینها که از جمعیت‌های بزرگ به‌طور تصادفی انتخاب شده استفاده نمی‌کنند، ممکن است خطرات ناشی از انواع مختلف را بیش از حد برآورد کنند.

در این مطالعه، محققان با جست‌وجوی داده‌های توالی‌یابی DNA در مقیاس بزرگ از 72434 فرد برای 37780 نوع شناخته‌شده و سپس اسکن سوابق سلامتی هر فرد برای تشخیص بیماری مربوطه، با این موضوع مقابله کردند. جستجوی گسترده شامل 29039 شرکت کننده در Bio کوه سینا بودمن® برنامه Biobank و 43395 شرکت کننده که بخشی از Biobank انگلستان بودند.

این مطالعه توسط Iain S. Forrest، کاندیدای دکترای دکتری در آزمایشگاه دکتر Do’s رهبری شد که از تجربیات بالینی قبلی خود الهام گرفت که او به عنوان بخشی از یک فلوشیپ فوق لیسانس در مؤسسه ملی بهداشت (NIH) داشت.

آقای فارست گفت: «ایده این مطالعه از یک جلسه طوفان فکری به وجود آمد. “دکتر دو و من در مورد نیاز به داشتن یک سیستم بهتر برای طبقه بندی خطر بیماری بحث کردیم. در حال حاضر، انواع با برچسب های گسترده ای مانند “بیماری زا” یا “خوش خیم” طبقه بندی می شوند. همانطور که در کلینیک یاد گرفتم، این برچسب‌ها فضای خاکستری زیادی دارند. آن زمان بود که متوجه شدیم بانک‌های زیستی که داده‌های توالی DNA را به پرونده‌های سلامت الکترونیکی مرتبط می‌کنند، فرصتی بی‌نظیر برای رفع این نیاز هستند.”

نتایج اولیه نشان داد که 157 بیماری در مجموعه داده‌های آن‌ها را می‌توان به 5360 گونه مرتبط دانست که توسط ClinVar، یک کتابخانه عمومی با مرجع گسترده و پشتیبانی شده توسط NIH یا «از دست دادن عملکرد» که توسط الگوریتم‌های بیوانفورماتیک پیش‌بینی شده بود، به عنوان «بیماری‌زا» تعریف شدند. . به طور متوسط، “نفوذ” یا شانسی که یک نوع با تشخیص بیماری مرتبط است، پایین بود، به ویژه 6.9 درصد. به همین ترتیب، میانگین تفاوت خطر، که افزایش خطر بیماری را برای فردی که این نوع را دارد نسبت به فردی که آن را ندارد، توصیف می‌کند، نیز کم بود.

دکتر دو گفت: “در ابتدا از نتایج کاملا شگفت زده شدم. خطراتی که ما کشف کردیم کمتر از آن چیزی بود که انتظار داشتم.” “این نتایج سوالاتی را در مورد اینکه چگونه باید خطرات این انواع را طبقه بندی کنیم، ایجاد می کند.”

با وجود این نتایج، خطرات مرتبط با برخی از انواع ژنتیکی همچنان بالا بود. به عنوان مثال، انواع بیماری‌زای ژن‌های سرطان سینه BRCA1 و BRCA2 هر دو به طور متوسط ​​38 درصد نفوذ داشتند، با انواع مختلف بین صفر تا 100 درصد.

نتایج بیشتر مزایای دیگر استفاده از داده‌های بانک زیستی را نشان داد. در یک مثال، محققان توانستند خطرات انواع مختلفی را که با اختلالات مرتبط با سن مرتبط هستند، مانند برخی از اشکال دیابت نوع 2 و سرطان سینه و پروستات، محاسبه کنند. به طور متوسط، نفوذ این گونه ها برای افراد بالای 70 سال حدود 10 درصد بود در حالی که برای افراد بالای 20 سال حدود 8 درصد بود.

این تیم همچنین دریافت که وجود برخی از انواع مختلف می تواند به قومیت افراد بستگی داشته باشد و بیش از 100 گونه را شناسایی کردند که به طور خاص در افراد غیر اروپایی تبار یافت می شوند.

در نهایت، نویسندگان چندین روش بالقوه را فهرست کردند که خود مطالعه می‌توانست خطرات گزارش‌شده را کمتر یا بیش از حد برآورد کند.

دکتر دو گفت: «در حالی که باید تحقیقات بیشتری انجام شود، ما احساس می‌کنیم که این مطالعه گام اول خوبی برای در نهایت ارائه اطلاعات دقیق و ظریف به پزشکان و بیماران برای تشخیص دقیق‌تر است.»