[ad_1]
توسعه امضای BRCA-mt. نمایندگی UMAP از BRCA-mt و BRCA-نمونه های wt از همه گروه های ارزیابی شده بدون (آ) و بعد از (ب) تنظیم دسته ای (ن= 653). نمودارهای آتشفشانی که miRNA های متفاوت بیان شده را نشان می دهد BRCA -نمونه های جهش یافته و نوع وحشی بدون (ج) و بعد از (د) تنظیم دسته ای (ن= 521)؛ علامت های قرمز نشان دهنده miRNA ها با پ< 0.01 و FC > 1.5 یا <0.66; نشانه‌های بنفش نشانه‌هایی را نشان می‌دهند که در هر دو مقایسه قابل توجه بودند. بسته Limma برای مقایسه بیان miRNA بین گروهی استفاده شد که تنظیم نشده ارائه شد پ مقادیر، و FCs با الگوریتم لیما محاسبه شد. ه نقشه حرارتی 19 miRNA با همگرا BRCA-mt; BRCAپروفایل های wt بدون توجه به پیش پردازش داده ها. خوشه بندی در درجه اول توسط BRCA وضعیت بدون الگوی واضح BRCA1 یا BRCA 2 یا تداخل با اوفورکتومی قبلی (ن= 521). برای تعیین ساختار خوشه از فاصله اقلیدسی و پیوند کامل استفاده شد. اعتبار: ارتباطات طبیعت(2023). DOI: 10.1038/s41467-023-38925-4
بر اساس یک مطالعه جدید، محققان موسسه سرطان Dana-Farber، بیمارستان زنان بریگهام و دانشگاه پزشکی لودز راهی برای تشخیص افزایش خطر سرطان مرتبط با جهش‌های BRCA1 و BRCA2 بدون تعیین توالی ژنتیکی یافته‌اند. ارتباطات طبیعت.
ارزیابی بر اساس وجود جهش ژن BRCA1/2 نیست. بلکه بر اساس تغییرات عملکردی است که زمانی اتفاق می‌افتد که مسیری که آنها و سایر ژن‌ها تنظیم می‌کنند به درستی کار نمی‌کند. نویسنده ارشد و محقق Dana-Farber، Dipanjan Chowdhury، Ph.D. می‌گوید: «برای اولین بار، سیگنالی در خون برای تشخیص آسیب‌شناسی مرتبط با افزایش خطر سرطان پیدا کردیم.
این روش جدید تشخیص خطر می‌تواند مبنایی برای روشی در دسترس‌تر، مقرون‌به‌صرفه‌تر و بالقوه جامع‌تر برای تشخیص خطر ارثی سرطان سینه یا تخمدان باشد.
ژن‌های BRCA1 و BRCA2 بخشی از مسیر وسیع‌تری هستند که تعمیر DNA را تنظیم می‌کنند. جهش‌های خاص در این ژن‌ها باعث می‌شود مسیر ترمیم ضعیف‌تر شود و خطر سرطان سینه، تخمدان، پانکراس یا پروستات افزایش یابد. در ایالات متحده، آزمایش ژنتیکی برای جهش در این ژن ها ممکن است برای افرادی با سابقه خانوادگی این سرطان ها توصیه شود. افرادی که آزمایش آنها مثبت است، این گزینه را دارند که غربالگری یا جراحی اضافی را برای کاهش یا از بین بردن خطر ابتلا به سرطان دنبال کنند.
با این حال، از 1 میلیون ناقل مشکوک جهش BRCA1/2 در ایالات متحده، تنها 10٪ می دانند که ناقل هستند. در هند، آزمایش برای جهش های BRCA حتی در دسترس نیست. یک ابزار در دسترس‌تر برای تشخیص می‌تواند این امکان را برای افراد بیشتری فراهم کند که از خطر بالای سرطان ارثی مطلع شوند.
“اگر ما یک آزمایش در دسترس و مقرون به صرفه برای خطر سرطان ارثی داشته باشیم که می‌توانی آن را به عنوان یک آزمایش فیزیکی سالانه انجام دهیم، به همان روشی که برای دیابت یا خطر بیماری قلبی آزمایش می‌کنیم، چه؟ چاودری می گوید. این نتایج مطالعه حاکی از آن است که چنین آزمایشی در قلمرو امکان قرار دارد.
سیگنال افزایش خطر Chowdhury که در خون یافت می شود وجود یک صورت فلکی خاص از microRNA ها است. MicroRNA ها مولکول های RNA کوتاه، غیر کدکننده و سنجاق سر هستند که در خون ما گردش می کنند. آنها به طور فزاینده ای به عنوان نشانگرهای زیستی بیماری مورد استفاده قرار می گیرند.
وجود یک صورت فلکی خاص از microRNA ها نشانه ای از شکست فعال آن فرآیند ترمیم DNA است – کمی شبیه به ضربه متمایز موتور خودرو که ممکن است هنگام شروع از کار افتادن یکی از اجزای آن ایجاد کند. فقدان آن صورت فلکی نشانه‌ای از فرآیند تعمیر DNA در حال کار است – آرام مانند موتوری که خرخر می‌کند.
در مطالعه اثبات مفهوم، این تیم نمونه خون 653 نفر را از شش مخزن زیستی، چهار در ایالات متحده، یک در لهستان و یک نفر در هند تجزیه و تحلیل کردند. حدود نیمی از نمونه‌ها دارای جهش BRCA هستند و نیمی دیگر فاقد جهش هستند.
این تیم از توالی یابی نسل بعدی برای شناسایی microRNA ها در هر نمونه استفاده کرد و یک مجموعه داده حاوی microRNA ها و وضعیت جهش BRCA برای هر نمونه ایجاد کرد. همکاران Chowdhury در دانشگاه پزشکی لودز از یادگیری ماشینی برای شناسایی نشانه‌ای استفاده کردند – آن صورت فلکی منحصر به فرد از microRNAها – که فقط در نمونه‌های مثبت برای جهش‌های BRCA دیده می‌شود.
مدلی که آنها ایجاد کردند، وجود جهش های BRCA را در 94 درصد موارد به درستی شناسایی کرد، که تأیید قوی ای را ارائه می دهد که سیگنال راه جدیدی برای شناسایی خطر بالای سرطان است.
این مطالعه اثبات مفهوم به شدت اعتبار سیگنال را ارزیابی می کند و مبنایی برای آزمایش بالینی که می تواند در یک امتحان سالانه مورد استفاده قرار گیرد، تشکیل نمی دهد. با این حال، یک آزمایش بالینی مقرون به صرفه امکان پذیر است.
آزمایش‌های PCR – همان فناوری که برای تشخیص عفونت‌های COVID-19 استفاده می‌شود – می‌تواند به جای توالی‌یابی نسل بعدی برای شناسایی امضای microRNA استفاده شود و آن را مقرون به صرفه و در دسترس می‌سازد. علاوه بر این، Chowdhury می‌گوید، دقت مدل مورد استفاده برای تشخیص صورت فلکی microRNA با استفاده از مجموعه داده‌های بزرگتر و بزرگتر آموزش داده می‌شود.
Chowdhury این فرضیه را مطرح می‌کند که این آزمایش همچنین می‌تواند نشانه جامع‌تری از افزایش خطر در مقایسه با توالی ژنتیکی ژن‌های BRCA1 و BRCA2 باشد، زیرا این آزمایش نشانه‌هایی از آسیب‌شناسی را در عمل نشان می‌دهد – مهم نیست که کدام جهش ژنی باعث آن می‌شود. در حال حاضر، آزمایش‌های ژنتیکی تنها نقص‌های شناخته‌شده در چند ژن شناخته‌شده در ژنوم را نشان می‌دهد که می‌تواند روند ترمیم DNA را مختل کند.
Chowdhury می‌گوید: «ما دائماً در حال کشف ژن‌ها و جهش‌های جدیدی هستیم که می‌توانند بر این مسیر تأثیر بگذارند، بنابراین انجام آزمایش‌های ژنتیکی دشوار است. آزمایشی که مستقل از آن باشد و نشان دهد شما در مسیر مشکل دارید، می‌تواند به طور گسترده‌تری افراد در معرض خطر را شناسایی کند.»
با تکیه بر این کار، Chowdhury یک مطالعه بالینی در حال انجام دارد تا احتمال استفاده از یک آزمایش مشابه برای غربالگری سرطان تخمدان در مراحل اولیه را بررسی کند. این تحقیقات از یک مطالعه گذشته نگر قبلی الهام گرفته شده است که نشان می دهد یک صورت فلکی متمایز از microRNA در هنگام شروع سرطان ظاهر می شود.
اطلاعات بیشتر:
کوین الیاس و همکاران، شناسایی حامل های ماده جهش BRCA1/2 با استفاده از پروفایل های microRNA در گردش، ارتباطات طبیعت(2023). DOI: 10.1038/s41467-023-38925-4
ارائه شده توسط موسسه سرطان دانا فاربر
نقل قول: مطالعه جدید نشان می دهد آزمایش ساده می تواند خطر سرطان سینه و تخمدان را بدون تعیین توالی ژنتیکی تشخیص دهد (2023، 8 ژوئن) که در 8 ژوئن 2023 از https://medicalxpress.com/news/2023-06-simple-breast-ovarian-cancer-genetic بازیابی شده است. .html
این برگه یا سند یا نوشته تحت پوشش قانون کپی رایت است. به غیر از هرگونه معامله منصفانه به منظور مطالعه یا تحقیق خصوصی، هیچ بخشی بدون اجازه کتبی قابل تکثیر نیست. محتوای مذکور فقط به هدف اطلاع رسانی ایجاد شده است.
[ad_2]