گروه کوچکی از انواع ژنتیکی که در بیماران شدیداً بیمار مبتلا به کووید یافت می‌شوند ممکن است به توضیح تفاوت‌های بزرگ در نحوه بیمار شدن افراد کمک کنند –

دکتر راویندرا کوله، مدیر آزمایشگاه باطنی و مولکولی جورجیا می گوید: “ویروس باید به سلول های ما بچسبد، باید به داخل سلول های ما نفوذ کند و باید در داخل سلول های ما تکثیر شود. همچنین باید التهاب را جذب کند.” کالج پزشکی جورجیا در دانشگاه آگوستا. ما ژن هایی را با تغییرات ساختاری در افراد بسیار بیمار شناسایی کرده ایم که بخشی از هر چهار فرآیند ضروری است.

ظاهراً در اولین مطالعه از نوع خود، محققین از نقشه برداری ژنوم نوری برای به دست آوردن یک ارزیابی کامل و سه بعدی از ژنوم 52 بیمار مبتلا به کووید-19 که چندین بیمار مبتلا هستند، استفاده کردند.

در نه نفر از بیمارترین بیماران، آنها هفت نوع ساختاری نادر را شناسایی کردند که در مجموع بر 31 ژن درگیر در مسیرهای کلیدی میانجی پاسخ بین یک فرد یا میزبان و یک ویروس تأثیر می گذارد. اینها شامل ایمنی ذاتی، دفاع ایمنی خط مقدم ما در برابر مهاجمانی مانند ویروس ها می شود. پاسخ التهابی، پاسخی کلیدی به عفونتی که در صورت ناهنجاری، می‌تواند ریه‌های برخی از بیمارترین بیماران را نیز از بین ببرد. و توانایی یک ویروس برای تکثیر و انتشار. به عنوان مثال، یکی از انواعی که آنها شناسایی کردند می تواند به بیان بیش از حد ژن های کراتین منجر شود. کراتین ها پروتئین هایی هستند که اجزای ساختاری چیزهایی مانند مو و ناخن ما هستند، اما به عنوان کلیدی برای انتقال هر دو ویروس آنفولانزا و ویروس COVID-19 بین سلول ها شناخته شده اند و مشخص شده است که در طول مسیر در دستگاه تنفسی تنظیم می شوند. یک عفونت

کوله، نویسنده مسئول این مطالعه که توسط کنسرسیوم مشترک بین المللی تحقیقات ژنوم میزبان COVID-19 در مجله منتشر شده است، می گوید: “این یک بیش فعال سازی سیستم های عادی است.” آی ساینس.

کله می‌گوید: «میلیون‌ها نفر مبتلا می‌شوند و خوشبختانه درصد بسیار کمی علامت‌دار می‌شوند و درصد بسیار کمی از افراد علامت‌دار به اکسیژن نیاز دارند و درصد کمی از این افراد در بیمارستان بستری می‌شوند و می‌میرند». “اما حتی درصد کمی از میلیون ها نفر را تشکیل می دهد و این بسیار زیاد است.”

محققان می نویسند: «داده های ما نشان می دهد که (انواع ساختاری) بزرگ شناسایی شده با استفاده از نقشه برداری ژنوم نوری ممکن است تنوع بالینی بین فردی را در پاسخ به COVID-19 بیشتر توضیح دهد.

انواع ساختاری بزرگ بخش زیادی از تنوع ژنتیکی را در بین ما به حساب می‌آورند، از جمله تغییراتی که منحصر به فرد هستند و تغییراتی که می‌توانند خطر ابتلا به مشکلاتی مانند سرطان را افزایش دهند. نقشه برداری ژنوم نوری یک فناوری نوظهور است که می تواند این گونه های بزرگتر را با تغییرات متعدد، مانند حذف یا درج مواد ژنتیکی و/یا زمانی که بخشی از کروموزوم معکوس می شود، شناسایی کند.

محققان می گویند که اگرچه کار بیشتری باید انجام شود، یافته های آنها در مورد نقش بالقوه گونه های ساختاری در تعامل میزبان-ویروس به نیاز به جستجوی تغییرات ژنتیکی، به طور ایده آل با یک آزمایش خون ساده برای استفاده، اشاره دارد. کوله می گوید، پس از شناسایی، هدف شروع اقدامات پیشگیرانه برای این افراد مانند اطمینان از واکسیناسیون و تقویت و درمان بالقوه تهاجمی تر در اوایل، مانند درمان آنتی بادی مونوکلونال، برای کمک به این افراد برای مبارزه بهتر با کووید است.

مطالعات بالینی عواملی مانند سن بالاتر، مرد بودن، فشار خون بالا، دیابت و سایر شرایط مزمن را به عنوان عوامل خطر مرتبط با درجه بیماری ناشی از COVID-19 شناسایی کرده اند. 9 بیمار در این مطالعه دارای شرایط مشترک مشترک بودند، 32 نفر از بیماران به تهویه مکانیکی برای حمایت از تنفس خود نیاز داشتند و در مجموع 13 نفر از 52 بیمار در مراقبت های ویژه فوت کردند.

اما در مطالعات آنها، که همچنین شامل افراد منفی برای ویروس کووید-19 و افرادی که مثبت بودند اما بدون علامت بودند، مجدداً موارد پرت وجود داشت، از جمله افراد مبتلا به بیماری های همراه که هنگام آلوده شدن به SARS-CoV-2 بدون علامت باقی ماندند و افرادی که کوله می‌گوید: کاملاً سالم بودند، اما وقتی آلوده شدند، به شدت بیمار شدند که یکی دیگر از شاخص‌های نقش ژنتیک در تعیین درجه پاسخ است.

کوله خاطرنشان می کند که انواع ساختاری بزرگی که آنها در بیمارترین بیماران یافتند ناشی از ویروس نبوده بلکه توسط ویروس استفاده می شود و ممکن است حساسیت به سایر شرایط، حتی مشابه، را افزایش ندهد.

به طور کلی، افراد در این مطالعه حدود 40 نوع ساختاری کمیاب داشتند که سایر مطالعات نشان داده اند که این رقم در حد متوسط ​​است.

کنسرسیوم تحقیقات ژنوم میزبان COVID-19 در حال حاضر دارای عضویت 34 موسسه است، از جمله دانشگاه های دوک و کلمبیا، موسسه ملی سرطان و مرکز ژنوم نیویورک، که جنبه های مختلف چگونگی تاثیر انواع ساختاری بر پاسخ های فردی متفاوت به عفونت با کووید را بررسی می کند. -19 ویروس.

این گروه پس از مطالعات متداول‌تر توالی‌یابی ژن، که اساساً DNA را در یک خط مستقیم قرار می‌داد تا به دنبال تغییرات مشکل‌ساز و کوچک‌تر در ترتیب معمول چهار جفت باز آن – آدنین، تیمین، گوانین و سیتوزین– روی آن‌ها باشد، ظهور کردند. هزاران بیمار اطلاعات کمی برای کمک به توضیح – و در حالت ایده آل پیش بینی – تغییرات گسترده در نحوه بیمار شدن افراد به دست آورده اند. بر اساس پایگاه داده جهش ژن انسانی، بهتر از 30 درصد از انواع شناخته شده بیماری زا بزرگتر از توالی تغییرات جفت باز منفرد هستند.

کوله می گوید، حتی میزان ویروس در یک فرد مستقیماً با میزان بیماری فرد ارتباط ندارد. او می‌گوید: «ما افرادی با بارهای ویروسی بسیار بالا داشتیم که حتی نمی‌دانستند مثبت هستند. “این چیزی در ژنوم میزبان است که متفاوت است.”

برخی از مطالعات نشان داده‌اند که گروه خونی ممکن است عاملی در پیش‌بینی خطر، به‌ویژه نوع A باشد، و همچنین یافته‌های ژنی خاصی وجود دارد که مستعد کمبودهای ایمنی است که ممکن است افراد را مستعدتر کند.

کوله، که همچنین معاون مدیر ژنومیک در مرکز سرطان جورجیا است، از نقشه برداری ژنوم نوری برای جستجوی تغییرات ایجادکننده سرطان خاص بیمار استفاده کرده است.